Ассоциация образовательных и научных учреждений «Сибирский Открытый Университет» создана 26 января 1998 года по инициативе учредителей:

• Алтайского государственного университета (АГУ),
• Новосибирского государственного технического университета (НГТУ) и
• Национального исследовательского Томского государственного университета (НИ ТГУ).

Ассоциация как юридическое лицо зарегистрирована в г. Томске. Президентом Ассоциации был избран ректор Томского госуниверситета, профессор Майер Георгий Владимирович. С 2016 года президентом ассоциации является ректор НИ ТГУ профессор Галажинский Эдуард Владимирович.

Ассоциация — первый в Сибири консорциум университетов, ставящий своей целью создание единого научно-образовательного пространства на основе современных средств телекоммуникаций и технологий дистанционного обучения, объединяющего интеллектуальные ресурсы вузов и научных учреждений региона. Достижение этой цели позволит значительно расширить образовательный рынок вузов — членов Ассоциации и создать качественно новую систему образования, основанную на принципах открытого доступа к информационным базам, фундаментальности образовательных программ, индивидуальности процесса обучения.